Eind 2001 werden er vanuit het Vlaamse sportbeleid belangrijke eerste stappen gezet om het topsportklimaat in Vlaanderen op een hoger niveau te brengen. Vanuit de bezorgdheid om meer efficiëntie, transparantie en objectivering te brengen in het Vlaamse topsportbeleid werd eind 2001 het Vlaams Overlegplatform Topsport (VOT) opgericht. Ook in dit jaar werd het Instituut Topsport Vlaanderen (ITV) opgericht, maar dat werd later geïntegreerd in het BLOSO wat leidde tot de oprichting van de afdeling Topsport (1 juli 2003).
In september 2003 lanceerde de minister president van de Vlaamse Regering, het idee om de Olympische Spelen van 2016 naar Vlaanderen te halen. In december 2003 werd door de minister van Sport de VOT vervangen door de Stuurgroep Topsport die tegen april 2004 een actieplan moest opstellen met het oog op de voorbereidingen van de Olympische Spelen 2016.
De toenmalige minister Guy Vanhengel (2002-2003) nam de realisatie van dit integraal topsportbeleid als één van zijn beleidsprioriteiten. Sinds 2003 werd dit beleid achtereenvolgens door minister Marino Keulen (2003-2004), minister Bert Anciaux (2004-2008) en nu minister Philippe Muyters (2009-2014) verder gezet en verder uitgebreid. Vanaf 2009 kreeg BLOSO de éénloket-functie voor topsport.